Метка: происхождение жизни

Хороший геккелист — все равно геккелист, или Обещанный пост о новой книге (часть 4)

Часть 1.
Часть 2.
Часть 3.

Разобравшись с тем, что написано о возникновении генетического кода и системы биосинтеза белка, вернемся к главе 10 и посмотрим на группу глав, в которых ведется речь об обмене веществ. В главе 10 идет речь о рибозимах как катализаторах различных важных для жизни реакций; лейтмотив этой главы прост и решителен – рибозимы могли это делать. Для некоторых реакций им нужны были коферменты — малые молекулы, которые осуществляют катализ, будучи в комплексе с ферментами, которые сейчас являются белками, а в ту давнюю пору были рибозимами. Поскольку модельные синтезы коферментов проводились с некоторой долей успеха, автор принимает факт их существования в мире РНК. Более того, аминокислоты и пептиды могли выполнять каталитические функции в составе рибозима. Настоящих белков еще не было, но короткие пептиды могли, по мнению геккелистов, существовать.

Читать далее…

1+

Хороший геккелист — все равно геккелист, или Обещанный пост о новой книге (часть 3)

Продолжая некогда начатый разговор о книге Никитина «Происхождение жизни» (здесь и здесь вы найдете предыдущие посты по этой теме), перейду от главы 9, посвященной т.н. миру РНК, к главе 13 о происхождении рибосом, белков и нуклеинового кода. Главы 10-12 можно смело пропустить, поскольку речь в них идет о возникновении обмена веществ, т.е. вещах важных, но (а) не принципиальных и (б) не в полной мере возможных до событий, о которых идет речь в главе 13. Возможно, мы вернемся впоследствии к этому разделу, но сейчас рассмотрим принципиально важные вопросы возникновения биологического кода.

Читать далее…

1+

Книга Михаила Никитина «Происхождение жизни. От туманности до клетки»

Книга М. Никитина “Происхождение жизни. От туманности до клетки”. в целом неплохо рассказывает читателю о состоянии исследований в этой области. В ней более откровенно, чем во многих подобных работах, говорится о существующих проблемах. К недостаткам книги следует отнести то, что ссылки на научные работы, о которых идет речь, даются не всегда. Это в принципе допустимо для популярной книги, но делает крайне неудобным проверку утверждений автора. Поэтому создается впечатление (и, возможно, верное), что такой подход выбран сознательно.

Хороший геккелист — все равно геккелист, или Обещанный пост о новой книге (часть 1). 29.11.2017.

Легкомысленно пообещав (почти все обещания несут оттенок легкомыслия) написать отзыв о новой книге на тему, которую я в шутку называю геккелизмом, я вынужден хотя бы частично это обещание исполнить. Для понимания моего отношения к геккелизму, т.е. к попытками научного анализа проблемы возникновения жизни, которые неизменно приводят к тем же ответам, которыми уже поделился с публикой знаменитый естествоиспытатель 19 века Э. Геккель, известный всем открытием монер (написано правильно, не мАнер, а мОнер*)… На примере нескольких критических глав я постараюсь показать, что (а) извлеченный из шляпы кролик оказывается не решением проблемы, как это объявляется, а обычной иллюзией, используемой фокусниками, и (б) многие утверждения, якобы описывающие экспериментальные факты, не являются истинными. Два эти обстоятельства делают большую часть выводов автора несостоятельными. Структура книги вполне соответствует классической схеме книг подобного рода, что в целом положительно. Первые главы книги посвящены Солнечной системе, ее происхождению, геологии планет земной группы, а также эволюции и современному состоянию их атмосфер. Действительно, эти вопросы имеют прямое отношение к обсуждаемой проблеме.

Хороший геккелист — все равно геккелист, или Обещанный пост о новой книге (часть 2). 09.12.2017.

В следующей, восьмой главе речь идет о происхождении хиральной чистоты молекул в предбиологических условиях. Если молекулы, имеющие стереоизомеры (идентичные структуры, которые выглядят, как зеркальные отражения или как две ладони у человека – вроде бы одинаковые, а перчатки почему-то разные, отчего и называют такую асимметрию хиральностью, от слова «хирос» — рука), играют роль в биологических процессах, все молекулы одного вида будут в этом отношении одинаковы – или левый стереоизомер, или правый. Но в абиогенных синтезах обычно получаются рацематы, т.е. смеси равных количеств двух изомеров.

Хороший геккелист — все равно геккелист, или Обещанный пост о новой книге (часть 3). 16.07.2018.

Продолжая некогда начатый разговор о книге Никитина «Происхождение жизни», перейду от главы 9, посвященной т.н. миру РНК, к главе 13 о происхождении рибосом, белков и нуклеинового кода. Главы 10-12 можно смело пропустить, поскольку речь в них идет о возникновении обмена веществ, т.е. вещах важных, но (а) не принципиальных и (б) не в полной мере возможных до событий, о которых идет речь в главе 13. Возможно, мы вернемся впоследствии к этому разделу, но сейчас рассмотрим принципиально важные вопросы возникновения биологического кода.Текст книги, следующий непосредственно за главой 9, содержит довольно фальшивую ноту. Немотря на то, ч то ни один из экспериментов неплохо описанных в главе 9 не продемонстрировал самовоспроизведения РНК-энзимов (рибозимов), дальнейшее изложение начинается с утверждения «как только на Земле появляются молекулы РНК, которые как-то копируются, между ними начинается конкуренция» (это в главе 10, которую мы сейчас пропускаем ради быстрой промотки ленты вперед). Таким образом, в обычной геккелистской манере возникновение самокопирующих рибозимов постулируется без веской на то причины.

Хороший геккелист — все равно геккелист, или Обещанный пост о новой книге (часть 4). 20.07.2018.

На что полезно посмотреть в главе 12 об альтернативных биохимических основаниях жизни, так это на самое ее начало, где речь идет об определении жизни. Эта тема вечно молода и постоянно ускользает из рук тех, кто думает, что наконец-то схватил еепоперек живота. Этот вопрос приобрел довольно практическое значение в век космических исследований, о чем верно упоминает автор книги. В задачи программы “Викинг” и других программ НАСА входил поиск внеземной жизни, но для того, чтобы ее искать (используя при этом казенные деньги), следует знать, что искать. Иначе получается сказочное “пойди туда – не знаю куда (ладно, это они положим знают), и принеси то – не знаю что».

2+

Хороший геккелист — все равно геккелист, или Обещанный пост о новой книге (часть 2)

Первая часть здесь.

В следующей, восьмой главе речь идет о происхождении хиральной чистоты молекул в предбиологических условиях. Если молекулы, имеющие стереоизомеры (идентичные структуры, которые выглядят, как зеркальные отражения или как две ладони у человека – вроде бы одинаковые, а перчатки почему-то разные, отчего и называют такую асимметрию хиральностью, от слова «хирос» — рука), играют роль в биологических процессах, все молекулы одного вида будут в этом отношении одинаковы – или левый стереоизомер, или правый. Но в абиогенных синтезах обычно получаются рацематы, т.е. смеси равных количеств двух изомеров.

Так выглядят оптические изомеры

В главе описываются результаты наблюдений и экспериментов, которые позволяют предположить, что в некоторых реакциях иногда появляется некоторая степень асимметрии. Эту асимметрию можно усилить, если исходно вводить в реакцию оптический изомер. В общем, существуют намеки на пути возникновения хиральности, хотя мы, как и прежде знаем довольно мало.

Читать далее…

2+

Хороший геккелист — все равно геккелист, или Обещанный пост о новой книге (часть 1)

Легкомысленно пообещав (почти все обещания несут оттенок легкомыслия) написать отзыв о новой книге на тему, которую я в этом журнале в шутку называю геккелизмом, я вынужден хотя бы частично это обещание исполнить. Для понимания моего отношения к геккелизму, т.е. к попытками научного анализа проблемы возникновения жизни, которые неизменно приводят к тем же ответам, которыми уже поделился с публикой знаменитый естествоиспытатель 19 века Э. Геккель, известный всем открытием монер (написано правильно, не мАнер, а мОнер*), предлагаю пробежать некоторые мои заметки на эту тему: тюк (это ссылка на первую часть из пяти, можно найти все, нажимая на «продолжение следует» в конце каждой части), тюк, тюк, тюк, разгорелся наш утюг.

Книга, о которой идет речь — “Происхождение жизни. От туманности до клетки”, написанная М. Никитиным. Забегая вперед, скажу, что книга в целом неплохо рассказывает читателю о состоянии исследований в этой области. В ней более откровенно, чем во многих подобных работах, говорится о существующих проблемах, хотя каждый из таких рассказов все равно завершается извлечением белого кролика из помятой шляпы геккелиста. Но это тоже понятно – иначе нельзя рассказать широкой публике об исследованиях происхождения жизни естественным путем, если желаешь оставаться на правильной стороне истории и прогресса.

Обложка книги

Читать далее…

2+